答：咳嗽痊愈两个月后肺部仍有炎症的原因可能是感染没有完全清除、出现了新的感染、肺部慢性疾病等。

1. 感染没有完全清除：肺炎的治疗周期一般为 7～14 天，如果患者病情较重，可能需要更长的时间。如果在肺炎治疗过程中，用药不规范或疗程不足，可能会导致肺部感染没有完全清除，在咳嗽症状消失后的 2 个月仍能查出肺部有炎症。

2. 出现了新的感染：肺炎治愈后，如果患者的抵抗力较低，可能会再次感染其他病原体，从而导致肺部出现新的炎症。

3. 肺部慢性疾病：如果患者有慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张等肺部慢性疾病，即使肺炎已经治愈，也可能会因为这些基础疾病而导致肺部出现慢性炎症。

导致咳嗽痊愈两个月后肺部仍有炎症还可能有其他原因，如肺结核、肺部肿瘤等，建议及时就诊，明确原因，遵医嘱规范治疗。

*重要提示：科普内容不能作为疾病治疗依据，如有不适请前往正规医院就诊。