答：男孩排尿时生殖器疼痛，通常是由泌尿系统感染、结石、外伤等原因导致的，如果症状持续不缓解，建议及时就医，明确原因，遵医嘱进行治疗。

1. 泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，是男孩生殖器疼痛最常见的原因之一。主要是由于细菌、病毒等致病微生物感染所引起的，除了排尿疼痛外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、尿道口红肿等症状。

2. 泌尿系统结石：如膀胱结石、尿道结石等，也会导致男孩排尿时生殖器疼痛。通常还会伴有血尿、排尿困难等症状。

3. 外伤：如果男孩的生殖器受到外力的撞击、挤压等，可能会导致局部损伤，出现排尿时疼痛的症状。

男孩排尿时生殖器疼痛还可能是其他原因，如包皮过长、包茎等。如果男孩经常出现排尿时生殖器疼痛的症状，建议及时就医，进行详细的检查，以明确病因，尽早治疗。

*重要提示：科普内容不能作为疾病治疗依据，如有不适请前往正规医院就诊。