小龙虾栖息在湖泊、河流、水库、沼泽、池塘及沟渠中，有时也见于稻田，但在食物较为丰富的静水沟渠、池塘和浅水草型湖泊中较多。栖息地多为土质，特别是腐殖质较多的泥质（有较多的水草、树根或石块等隐蔽物）。当栖息地水体水位较为稳定时，小龙虾分布较多。
（1）广栖性
小龙虾的生命力很强，在自然条件下，不论在江河、湖泊、水库、沟渠、塘堰、稻田、池塘等水源充足的环境中，还是在沼泽、湿地等少水的陆地，只要不受严重污染，小龙虾就能生存和繁衍，形成自己的种群。小龙虾对水环境要求不高，在pH为5.8～8.2、温度为0～37℃、溶氧量不低于1.5mg/L的水体中都能生存，在我国大部分地区都能自然越冬。最适宜小虾生长的水体pH为7.5～8.2，溶氧量为3mg/L，水温为20～30℃。
（2）穴居性
小龙虾喜欢打洞穴居，具有利用洞穴保护自身的本能。打洞的位置通常在池埂、岸边水位线上下20cm的范围内，方向是笔直向下或稍倾斜。夏季洞穴深度一般为30cm左右，冬季达80～100cm。小龙虾白天入洞潜伏或守在洞口，夜间出洞活动；春季喜欢活动在浅水中，夏季喜欢活动在较深一点儿的水域，秋季喜欢在有水的堤边、坡边、埂边和曾经有水、秋天干涸的湿润地带营造洞穴，冬季喜欢藏身于洞穴深处越冬。
小龙虾掘洞时间多在夜间，可持续掘洞6～8h，成虾一夜挖掘深度可达40cm，幼虾可达25cm。成虾的洞穴深度大部分在50～80cm，少部分可以达到80～150cm；幼虾的洞穴深度在10～25cm；体长1.2cm的稚虾已经具备掘洞的能力，洞穴深度在10～20cm。洞穴分为简单洞穴和复杂洞穴两种：85%的洞穴是简单的，即只有一条隧道，位于水面上或水面下10cm；15%的洞穴较复杂，即有2条以上的隧道，位于水面以上20cm处。小龙虾一般不在池塘底部打洞。苗种生长期间不善打洞，所以，小龙虾是否掘洞可以作为判断其是否性成熟的标志。繁殖季节每个洞穴中一般有1～2只虾，但冬季也常发现1个洞中有3～5只虾。小龙虾在繁殖季节掘洞强度增大，在寒冷的冬季和初春，掘洞强度微弱。
（3）迁徙性
从生活习性来看，小龙虾是介于水栖动物和两栖动物之间的一种动物，能适应恶劣的环境。小龙虾利用空气中氧气的本领很高，离开水体后只要保持湿润，可以安然存活2～3天。当遇突降暴雨天气时，小龙虾喜欢集群到流水处活动，并趁雨夜上岸寻找食物或转移到新的栖息地；当遇到水中溶氧量降至1mg/L时，它也会离开水面爬上岸或侧卧在水面上进行特殊呼吸。
（4）喜温性
小龙虾属变温动物，喜温暖、怕炎热、畏寒冷，适宜水温18～33℃，最适水温22～30℃之间。当水温上升到33℃以上时，小龙虾进入半摄食或打洞越夏状态；当水温下降到15℃以下时，小龙虾进入不摄食的打洞状态；当水温下降到12℃以下时，小龙虾进入不摄食的越冬状态。
（5）格斗性
小龙虾严重饥饿时，会以强凌弱，相互格斗，弱肉强食，但在食物比较充足时，能和睦相处。另外如果放养密度过大、隐蔽物不足、雌雄比例失调、饵料营养不全时，也会出现相互撕咬残杀，最终以各自螯足有无决胜负。在稻田环形沟中种植水草，除了为小龙虾提供食物外，还可以增加小龙虾的活动空间，减少他们之间接触的机会，相当于减少了小龙虾的密度，为提高成活率创造条件。
（6）避光性
小龙虾喜温怕光，有明显的昼夜垂直移动现象，光线强烈时即沉入水体或躲藏到洞穴中，光线微弱或黑暗时开始活动，通常抱住水体中的水草或悬浮物将身体侧卧于水面。在小龙虾养殖稻田中，人工设置石棉瓦、树枝等遮蔽物，就是为了适应小龙虾的避光性。