（1）在植物科属中分布特点：有些植物次生代谢禅位于的分布具有专属性，如白头翁属植物中仅有白头翁一种含有羽扇豆烷型三萜皂苷；科属亲缘干系相近的植物，尤其是同属植物，常含有相同结构类型的次生代谢产物，五加科人参属中四环三萜和五环三萜皂苷；同种次生代谢产物分布在不同科属植物中，如小檗碱在毛茛科黄连、小檗科三棵针中
（2）生长发育不同时期的分布特点：不同植物在生长发育的不同时期，主要次生代谢产物不同，如辣椒素只在辣椒生育生长的后期才在果皮中合成并积累；同一植物在生长发
育的不同时期，主要此生代谢产物也不同，如人参中的人参皂苷含量随着植物年龄的增加而增加，
（3）不同采收时期的分布特点：植物的同一药用部分在不同采收期，所含化学成分不完全一样，如胡荽子党果实未成熟时，其挥发油主含桂皮醛和异桂皮醛，成熟时主含芳樟醇、杨梅叶烯；植物不同药用植物部位的采收期不同，次生代谢产物含量不同，如根及根茎药用部位，多在秋末春初或在植物生长停止、花叶凋谢的休眠期采收
（4）植物不同部位的分布特点：同一植株不同部位，其含量差别较大，如相思树树干基部皮的鞣质含量最高，向上含量渐少