（1）限制性酶图谱
①用识别较多核苷酸的内切酶
②选用其酶切位点在基因组中频率低的内切酶。可以提高限制性的应用范围。
（3）荧光原位杂交。荧光原位杂交技术是另一种物理图谱的构建方法。他通过荧光标记的探针与DNA分子杂交，使染色体上的杂交信号在显微镜下可直接观察。原位杂交的探针可用荧光或同位素标记。
（3）序列标签位点。利用某一已知序列为标签的位点作探针，与基因组DNA杂交，绘制物理图谱。作为标签需具备两个条件，一是其序列是已知的，以便用PCR检测，二是基因组中仅一个位点，没有重复。

1.基因组序列的测定
2.基因定位
3.基因组比较分析
4.标记辅助选择
5.基因的克隆与分离