由县级以上人民政府农业行政主管部门或者工商行政管理机关责令停止生产、经营，没收种子和违法所得，吊销种子生产许可证、种子经营许可证或者营业执照，并处以罚款；有违法所得的，处以违法所得5倍以上10倍以下罚款；没有违法所得的，处以2千元以上5万元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
对以非种子冒充种子、以此种品种种子冒充他种品种种子，以及生产、经营的种子属于因变质不能作种子使用的或者带有国家规定检疫对象的有害生物的，依照前款规定从重处罚。

良种场用于培育良种的土地、房屋、设备等资产受到保护。

良种场是属于各级政府设立的种子专项资金的扶助对象。