电泳缓冲液主要存在三种阴离子，Cl^-、甘氨酸阴离子以及蛋白质-SDS复合物，在浓缩胶的pH下，甘氨酸少量电离，其电泳迁移率最小，Cl^-电泳迁移率最大。在电场作用下，Cl^-最初的迁移速度最快，在Cl^-后形成低电导区，从而产生较高的电场强度，甘氨酸阴离子和蛋白质-SDS加速移动。达到稳定状态后，Cl^-和甘氨酸之间形成稳定移动的界面。

电泳技术可分为薄膜类和凝胶类。
常用的凝胶电泳技术有：聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶。