（1）必须保证酶分子与底物分子能够有效碰撞，为此，必须使酶与底物在反应系统中混合均匀。搅拌罐式反应器、流化床式反应器均具有较好的混合效果。填充床式反应器的混合效果较差。在使用膜反应器时，也可以采用辅助搅拌或者其他方法，以提高混合效果，防止浓差极化。
（2）有些酶催化反应，其反应产物对酶有反馈抑制作用。
对于具有产物反馈抑制作用的固定化酶，可以采用填充床式反应器；对于具有产物反馈抑制作用的游离酶，可以采用膜反应器。
（3）底物浓度的高低对酶反应速度有显著影响。
A.有高浓度底物抑制作用的酶，如果采用分批搅拌罐式反应器，可以采取流加分批反应的方式进行反应。
B.对于具有小分子高浓度底物抑制作用的游离酶，可以采用游离酶膜反应器进行催化反应；
C.对于具有高浓度底物抑制作用的固定化酶，可以采用连续搅拌罐式反应器、填充床式反应器。
（4）某些酶可以耐受100℃以上的高温，最好选用喷射式反应器。
（5）对于有气体参与的酶促反应，可选择鼓泡式反应器。

酶催化作用的特点有：
①专一性强（绝对专一性和相对专一性）；
②酶催化作用的效率高；
③酶催化作用的条件温和。