1.培养液（发酵液）的预处理和固液分离，目的是除去发酵液中的菌体细胞
2.初步纯化（提取），目的是除去与产物性质差异较大的杂质，为后道精制工序创造有利条件；
3.高度纯化（精制），目的是去除与产物的物理化学性质比较接近的杂质
4.成品加工。据最终用途决定。

传统：离心、过滤、蒸馏、萃取、结晶、吸附、蒸发和干燥
新近：细胞破碎、膜分离和色层分离、离子交换过程