（1）国有国营模式：即政府出资建设轨道交通设施，并指定政府下属机构、国有企业或国有控股公司负责轨道交通的运营管理。对运营管理中的亏损，政府通常采取财政补贴等措施给予补偿。该模式的特点是提供的服务带有福利性，但运营效率较低。
（2）国有民营模式：政府出资建设轨道交通设施，并通过租赁等形式将轨道交通的经营权转交给民营股份公司。运营者的行为受到政府相关法规的约束，但政府不干涉企业的运营管理，也不对运营亏损进行补贴。该模式的特点是有助于减轻财政支出和提高运营效率，但客流必须达到一定的数量级。
（3）民有民营模式：民间资本出资建设轨道交通设施，民营股份公司负责轨道交通的运营管理。政府通过合同形式对轨道交通投资建设、运营企业股本结构、票价浮动范围等进行约束，但政府不干涉企业的运营管理，也不对运营亏损进行补贴。该模式的特点是扩大了轨道交通建设资金来源，民间资本在控制成本方面有更大的动力，但轨道交通的公益性目标与民间资本的盈利性目标难免存在冲突。