血吸虫病临床表现复杂多样，根据感染的轻重程度，病期的早晚，虫卵沉积部位与人体的差异（免疫反应），临床表现分急性血吸虫病、慢性血吸虫病、晚期血吸虫病和异位损害。
（1）急性血吸虫病：潜伏期一般一个月左右。一般均有发热，发热长短不一，高低有异。热型以间歇型、弛型多见，早晚波动很大，或一日间有双峰热，有畏寒与盗汗，重者热至40℃；出现过敏反应：如荨麻疹、血管神经性水肿、淋巴结肿大；半数以上病人有腹痛、腹泻、个别出现脓血便；90%出现肝脾肿大；部分患者出现咳嗽、气喘、咯血痰或胸痛。
（2）慢性血吸虫病：经血感染者大多无症状，仅粪便检查中发现虫卵，或体检发现肝大而就诊治断为血吸虫病。慢性病人以腹泻最为常见，大便日2-3次，稀便或带粘液和血液，伴有里急后重，颇像痢疾，病程长者可出现肠梗阻、贫血、消瘦。重者出现内分泌紊乱，男性出现阳痿、性欲减退，女性出现月经紊乱。肝脾均肿大，早期肝大，发展为肝硬化则肝质地变硬，表面不平，有结节，脾脏越来越大。
（3）晚期血吸虫病：慢性继续发展到晚期血吸虫病，肝硬化与脾功能亢进、门脉高压症的出现。由于肝硬化的加重，脾脏肿大而肝脏缩小，此时患者免疫功能减退，易发生感染。
（4）异位损害：血吸虫正常寄生于门静脉系统，如病变发生于门静脉之外，称为异位寄生，成虫亦可异位寄生。寄生于肺为肺血吸虫病，寄生于脑为脑血吸虫病，其它如皮肤、阴囊、子宫颈、输卵管、心包等部位。异位损害，主要通过组织活检而发现。
其检查方法有以下几种：
（1）粪便：粪便中检测到虫卵或毛蚴可确诊血吸虫病。急性期阳性率高，晚期则阳性率下降。
（2）环卵试验：阳性率95%以上，假阳性率0.5-11.3%。
（3）酶标对流法：阳性率、准确性80%左右。
（4）酶标记免疫吸附检测抗体试验：敏感性和特异性均高。
（5）酶联免疫吸附试验检测特异性IgM、IgG、IgE法：血清IgM、IgE含量为早期诊断的重要依据。
（6）其它：如免疫功能的检测、内分泌功能的检测均可作为判断病情的参考。