（1）股份回购违反了资本维持和资本充实的原则
资本维持原则，强调公司在其存续过程中，应当经常保持与其资本额相当的财产，其目的在于维持公司清偿债务的能力，保护债权人的权益。资本是公司对外交往的一般担保和从事生产经营活动的物质基础。所以如果公司取得自己的股份，则形同股东出资返还，公司的资产因而就减少，这将危及资本的充实，有悖资本维持原则，可能剥夺对债权人的清偿机会，损害债权人的权益。
（2）违反股权平等原则
①易导致股东间机会的不平等
若公司不按股东的持股比例回购自有股份，而是随意地从一部分股东或一个股东买取自有股份，则势必造成机会不平等。机会的不平等使得部分股东得以获得出资返还，退出公司。剩余股东则可能因公司资金减少而负担较大的经营风险。尤其在公司经营不善、发生危机时，如果不按比例回购股份，则等于将被回购股份承担的公司风险转嫁于其他股东。
②可能表现在价格上的不公正
当公司回购股份的价格高于实际价值时，未被回购股东的股份价值就相应地被稀释；相反，当回购的价格低于真实价值时，则剩余股份的价值就相应被提高。最后，公司回购自有股份将减少已发行股份的总数，因而公司的表决控制权会随之而改变。回购的股份一般在公司持有期间并无表决权，故控制公司所需表决权较之在回购自有股份前也会相应降低。这样，控股股东就提高了自己表决权的控制力，有违股东平等原则。
③股份回购违反了股份交易公正原则
为内幕交易和操纵股价创造了条件，如果被允许收购自己的股份，公司得以任意操纵股票的价格，容易导致市场投机，对公司的股东来说是一种诈欺行为。公司内部人员利用其地位可掌握内部信息，通过买卖公司的股票获得不正当的权益，损害其他投资者的权益。
④从法理上看，公司不能同时成为自己的股东
公司为营利社团法人，具独立法律人格，其股东亦由具独立人格的自然人或法人担任。依照一人仅具一人格的法理，公司在理论上不可能同时成为自己的股东。也就是说，公司与其股东，均须为不同的独立人格者。因此，公司不能取得自己的股份，这是自法理推演的当然结论。而公司自有股份回购，会导致公司本身成为自己公司的股东，这与公司的理论基础互相冲突。