对于回函所确认的差异，审计师应认真分析。产生差异的原因可能是由于购销双方存在未达账项；可能是由于一方或双方记录错误；也可能是存在弄虚作假或舞弊行为。未达账项主要体现在：
①询证函发出时，债务人已经付款，而被审计单位仍未收到货款；
②询证函发出时，被审计单位的货物已经发出并已作销售记录，但货物仍在途中，债务人仍未收到货物；
③债务人由于某种原因将货物退回，而被审计单位尚未收到；
④债务人对收到货物的数量、质量、价格等有争议全部或部分拒付货款；
⑤债务人将货物退回后，被审计单位在询证日未及时审核批准，冲减应收账款。 审计师应将函证的过程和结果记录于工作底稿，并据以总结合评价应收账款情况。对函证结果可作如下评价：
①函证回函认可的金额小于函证金额，审计师应核实销售合同、发票、发货单位；以验证是否存在有意加大应收账款，虚增应收账款，目的是虚增销售收入，虚增利润的情况；
②函证回函认可的金额大于函证金额，应查明是否存在低估应收账款或人为调整期末余额的不正当行为；
③函证回函认可函证金额，说明应收账款的账面记录是真实的、正确的，则审计师可以合理地推断，全部应收账款总体是正确的。