1.多态性高；
2.共显性遗传；
3.在基因组中频繁出现，分布广；
4.选择中性；
5.容易获得；
6.容易操作；
7.所得数据可在实验室之间交流和比较。
DNA遗传标记应用：利用生物的DNA及基因信息，不仅可以打击犯罪、维护社会正义，而且还可以梳理不同生物间的关系。基因信息还可充当“过去时代的信使”，帮助古人类学家寻根问祖，探索人类的源头；亲子鉴定、皇室之谜、真假公主、调查走私；鉴别文物、探索起源。

（1）系谱分析法
（2）体细胞杂交（同线、缺失、剂量效应等）
（3）原位杂交
（4）分子遗传标记作图