内含子（intron） 断裂基因中的非编码序列称为内含子。通常在内含子的开放续框中编码具有三种功能的蛋白，这些蛋白与DNA或RNA的代谢有关。
（1）核酸内切酶：在DNA的靶位点剪切，使内含子得以插入；
（2）反转录酶：涉及将内含子RNA变成DNA拷贝；
（3）成熟酶：从前体的RNA中切掉内含子的部分。