能够直接或间接地促进基因组的重排：
移码活动本身可以导致缺失，倒置，或者致使一个多重序列移动到一个新的位置。转座子还 可作为一种可以重组细胞系统同源性轻便区域的酶作用物；不同位置的转座子的两个拷贝 （甚至在不同的染色体上）可以为互补重组提供位点。这样互换导致了缺失，插入，倒置，或是易位。