1、无症状阿米巴带囊者：首选“二氯散糠酸酯”，连用10天，次选 “双碘羟基喹啉”连用21天。
2、非痢疾性阿米巴结肠炎：首选“甲哨唑”。次选“二氯散糠酸酯”、“双碘羟基喹啉”或“巴龙霉素”。
3、普通型阿米巴痢疾：首选“甲哨唑”，＋二氯散糠酸酯或双碘。次选“依米丁”或去氢依米丁。
4、暴发型阿米巴痢疾：与普通型方案相同，但患者不能口服药物时，应采用0.5%甲硝唑100ml静点。连用2-3天再改口服，患者常伴细菌感染，应同时用其他抗生素，如庆大。
5、慢性型阿米巴痢疾：可选用2种或2种以上药物的联合疗法，也可用保留灌肠或中草药治疗