美国转基因安全管理以产品的特性和用途为基础，未单独立法。美国政府于1986年颁布了《生物技术法规协调框架》。协调框架将基因工程工作纳入现有法规进行管理，即在原有《联邦杀虫剂、杀菌剂、杀鼠剂法》、《有毒物质控制法》、《联邦食品、药物和化妆品法》、《联邦植物病虫害法》、《植物检疫法》的基础上增加了转基因产品有关条款。协调框架还规定，美国农业部（US Department of Agriculture，USDA）、美国环保署（Environmental Protection Agency，EPA）和食品药品监管局（Food and Drug Administration，FDA），是农业生物技术及其产品的主要管理机构，它们根据各自的职能对基因工程工作及其产品实施安全性管理。上述三个机构既有分工，又有协作。
美国农业部的职责是依照《植物病虫害法》和《植物检疫法》对转基因作物进行管理，负责转基因产品的种植安全。环保署依照《联邦杀虫剂、杀菌剂、杀鼠剂法》、《联邦食品、药物和化妆品法》对杀虫剂（包括植物杀虫剂，即转抗虫、抗病基因产生的蛋白质）进行管理。食品药品监管局依照《联邦食品、药物和化妆品法》，负责评估食品和食品添加剂的安全以及标识管理。