我国转基因生物安全管理技术支撑体系主要包括安全评价体系、检测体系和标准体系。
（一）安全评价体系。农业部按照《农业转基因生物安全管理条例》的规定，组建了国家农业转基因生物安全委员会（以下简称安委会），负责农业转基因生物的安全评价工作，为转基因生物安全管理提供技术咨询。安委会委员由从事农业转基因生物研究、生产、加工、检验检疫、卫生、环境保护等方面的专家组成，每届任期三年。安委会委员由农业转基因生物安全部际联席会议成员单位推荐，农业部聘任组建。自《农业转基因生物安全管理条例》实施以来，农业部已相继组建了三届安委会。第三届安委会共有60名委员，其中植物及植物微生物专家29名，动物及动物用微生物专家11名，食用安全专家18名，管理类2名，分别来自教育、中科院、卫生、食品药品监督管理、环境保护、质检和农业系统。
（二）检测体系。根据《农业转基因生物安全评价管理办法》规定，检测机构的职责作务：一是农业转基因生物安全管理和评价提供技术服务；二是承担农业部或申请人委托的农业转基因生物定性定量检验、鉴定和复查任务；三是出具检测报告，做出科学判断；四是研究检测技术与方法，承担或参与评价标准和技术法规的制修订工作。已有37个通过认证获得检测机构的资质。
（三）标准体系。国家农业转基因生物安全管理标准化技术委员会（以下简称标委会）由国家标准化管理技术委员会依法批准成立。标委会主要负责转基因植物、动物、微生物及其产品的研究、试验、生产、加工、经营、进出口及与安全管理方面相关的国家标准制修订工作，对口食品法典委员会（CAC）的政府间特设生物技术食品工作组等技术组织与农业转基因生物安全管理有关的标准制定工作。现有委员41名。已编制完成《农业转基因生物安全管理标准化体系规划》，研制的81项转基因标准已发布实施。