由于学科本位体育课程模式的理论基础，决定了在体育课程目标设置上，强调体育科学本身的价值，课程要为科学本身的发展和进步服务，因此该课程目标的价值取向是以科学发展为前提，而很少考虑社会与学生对体育的具体要求。在具体课程目标设置上，强调通过各种教学手段让学生学习各种体育专业知识，技术技能，使每个学生能达到增强体质，掌握专项体育运动技能，甚至都能成为专门的“体育”人才。