（1）辐射对食品中微生物菌丛的选择性提高。
（2）存活微生物的突变几率提高。
（3）重复使用亚致死的辐射剂量从而使对辐射的抗性提高。
（4）辐射后，微生物的鉴定特征可能发生改变，从而导致种类或菌株不能正确的鉴别。
（5）产毒细菌或霉菌的毒素形成量提高。