根据生物样品内药物分析的对象和特点以及药物在生物样品内的存在形式、生物转化状况，欲进行体内药物及其代谢物测定，除少数情况将体液作简单处理后进行直接测定外，一般在测定之前需采取适当的样品预处理，即进行分离、净化、浓集、衍生化等，从而为药物的分析测定创造良好的条件。
药物在体内以多种形式存在，有原型药（游离型），有与生物分子形成的结合物（与蛋白结合型），有代谢物，有缀合物（与葡萄糖醛酸、硫酸形成的苷、酯等），需分别测定；待测物浓度很低，而生物样品的介质组分繁杂，有众多内源性成分（蛋白质、多肽、脂肪酸、色素、类脂等）和各种潜在的干扰物存在，还有一些共存药物以及各种外源性物质也会影响测定；待测药物类型众多，性质各异很难对样品规定固定的程序和方式，所以样品处理必须根据药物类型、理化性质、存在形式、浓度范围、测定目的、选取的生物样本类型及最后一步测定方法等多种因素，采取相应的分离步骤和净化技术。