理学的发展造成了封建正统法律思想的哲理化、直接影响到封建社会后期法律实践：
①刑罚被说成“存天理、灭人欲”的正义手段。因此统治阶级不再像以前那样忌讳严刑。对破坏封建统治秩序的违法犯罪施行严厉制裁；
②封建伦理道德观点获得理学的理论外衣之防。增加广迷惑性和欺骗性，加上统治阶级的极力提倡，渗透到社会生活各个方面、严重桎梏着劳动人民的精神活动，严重压抑了人民的权利观念，遏制了商品经济的发展。这种作用越到封建社会末期便越突出。