海水中有机物的来源有内部来源和外部来源之分。内部来源，又称自生的（autochthonous）是指：生物活动制造的有机物，与海洋初级生产力净值基本相当，但这部分有机物最终将分解为无机碳返回海水中，因此严格地讲不能作为海水有机物的真正“来源”。外部来源，又称外来的（allochthonous）包括：
1、河水径流（river run-off）。
2、大气输入（atomspheric transport）主要途径是降水。

表中海水中有机碳的河流与大气输入项合计为约0.40～0.53×10¹⁵gC/yr（净初级生产力），而迁出项合计约0.095～0.257×10¹⁵gC/yr，迁出不及输入的一半，显然，输入海洋的有机碳多数将转化成无机碳。