1）打开EDI系统控制电源。
2）开启EDI给水泵，将纯水入水和浓水补充调节阀缓慢旋开。
3）观察EDI入水的电导率，超过设定值时自动排放，水质合格后入水电磁阀打开，排水电磁阀关闭。
4）开启EDI浓水循环泵，慢慢旋开浓水和极水调节阀。
5）对浓水、纯水和极水管道实行脉冲供水以进一步从EDI系统中排除空气。在启动时除去空气很重要，因为组件里的气体会影响流量和产品水电导率。
6）将EDI模块电源打开，应尽快启动电源供电。如果在供电前，过量的水被送到组件中，那么模块有可能要进行再生一达到水质要求。
7）调节各阀门开关，使纯水压力和流量、浓水流量、极水压力和流量均达到设计范围。
8）慢慢旋动“电压调节”钮至规定的电压。
9）检查组件的初始电流。初始电流一般高于正常运行电流，多个组件并联运行时，两个组件的初始电流应当接近。
10）EDI运行一个小时之后，水质、电流应趋于稳定。