设臵综合课程是本次课程改革的重要特征，实施综合课程要注意以下三个问题：
①知识的琐碎化问题。在分科课程中，教师只需要处理某一学科领域中的问题；而在综合课程中，教师必须根据活动或任务的需要，选择许多学科领域中的知识并加以整合。这对习惯于传统分科教学的教师而言是很难适应的。经常出现的情况是把许多知识信息机械地甚至牵强地拼合起来，从而导致知识的琐碎化。
②教师的知识和经验问题。成功地实施综合课程需要教师掌握相关学科的知识，如果教师缺乏相关学科领域的知识技能，就不可能将这些知识技能有效地整合起来，这样就很可能导致综合课程形同虚设。另外，如果教师本人从未体验过综合课程，那么他们实施综合课程的难度将更大，要帮助教师从理论到实践两方面认识和解决综合课程的诸多问题，提高教师对综合课程的理解和信任。
③管理问题。要在教师的工作量计算、教学质量评估和学生学业考试上充分考试综合课程的特点，营造有利于实施综合课程的外部环境。