乙型肝炎病毒核心脱氧核糖核酸（HBVDNA）是乙型肝炎病毒核心成分脱氧核糖核酸的长链部分，它与e抗原（HBeAg）密切相关，其阳性反映了病毒的活动和复制。HBVDNA先于核心抗体IgM（抗-HBcIgM）阳性，与前驱症状持续时间一致，HBVDNA水平下降或阴转时出现表面抗原（HBsAg）和e抗原（HBeAg），说明HBVDNA可作为早期诊断的最敏感指标。
血清HBVDNA比HBsAg先清除，一般在HBeAg之前或同时转阴，说明HBVDNA在判断乙型肝炎病毒复制时比HBeAg更为敏感。
血清HBVDNA和HBeAg持续阳性是急性肝炎发展为慢性感染的标志。
前S₂蛋白（PreS₂）是乙肝病毒长链S编码区前S₂基因编码的病毒外壳蛋白，它出现在急性乙肝早期，但滴度低，发展为慢性时100%阳性，PreS₂阳性和病毒活动性复制及感染性有密切关系，还反映肝细胞受损害的程度。乙肝急性期PreS₂持续阳性达半年以上则提示慢性化，其被清除可以作为肝炎恢复的标志，所以PreS₂有助于急性肝炎的诊断和预后估计。
前S₂抗体（抗—PreS₂）是PreS₂刺激机体产生的抗体，有保护性抗体的作用，能中和循环血液内的乙肝病毒和阻止病毒侵入肝细胞，起到免疫清除作用，它是乙肝恢复期首先出现的抗体，所以抗-PreS₂阳性说明乙肝病毒在体内已被清除，患者完全痊愈。