（1）国际兽疫局规定的部分A类疾病，在我国存在不同程度的流行，导致我国畜产品难以出口；
（2）动物疫病的控制，未实行从“农场到餐桌”一条龙管理，多头管理现象严重，疫病控制的体制不顺；
（3）法制不健全，有法不依、执法不严现象还不同程度地存在；
（4）动物疫病的控制过分依赖疫苗，忽视综合性防制措施；
（5）基础研究相对薄弱，不能适应畜牧业快速发展的需要，一些重大传染病病原的生态学、分子流行病学及致病、免疫机制的研究一直是畜禽传染病防制研究中的薄弱环节
对策：（1）重视A类动物疫病的防制，报告制度、控制措施与国际接轨；
（2）理顺动物疫病控制的管理体制，杜绝多头管理现象；
（3）坚决贯彻“以法制病”、“预防为主”的方针；
（4）加强动物疫病的基础研究，进一步加快疫病防制措施的标准化建设。