离子色谱法测定无机阴离子时，不被色谱柱保留或弱保留的阴离子干扰F^-和Cl^-测定时，用强淋洗液进行洗脱。

《水质 无机阴离子（F^-、Cl^-、NO^-₂、Br^-、NO^-₃、PO^3-₄、SO^2-₃、SO4^2-₄）的测定 离子色谱法》（HJ 84-2016）质量保证和质量控制规定，空白试验结果应低于方法检出限，否则应查明原因，重新分析直至合格之后才能测定样品。

《水质 无机阴离子（F^-、Cl^-、NO^-₂、Br^-、NO^-₃、PO^3-₄、SO^2-₃、SO4^2-₄）的测定 离子色谱法》（HJ 84-2016）样品的采集和保存规定，采集的样品应尽快分析。若不能及时测定，于4℃以下冷藏、避光保存，测定前过滤。

在离子色谱分析中，若水负峰的保留时间与待测离子的保留时间相同或接近时，就会产生干扰。

为避免色谱柱容量的超载，在分析未知浓度的样品时，最好先稀释100倍进样，或用微量进样器进样1-2ul，再根据所得结果选择合适的稀释倍数或进样量，这样既可以避免色谱柱容量超载，又可以减少强保留组分对柱子的污染。

在离子色谱分析中，进样体积大，水负峰亦大；淋洗液的浓度越高，水负峰越小。

离子色谱的电导检测器内，电极间的距离G越小，死体积越小，则灵敏度越低。

由于树脂干裂造成柱子的分离度降低，可以用淋洗液在较低的流速和压力下淋洗柱子4h以上，必要时过夜。

离子色谱法测定阴离子时，利用淋洗液配制样品和标准溶液，使样品和标准溶液含有相同的淋洗液浓度，可以消除水峰的干扰。

单柱阴离子色谱由于选用了低电导淋洗液，所以可不用抑制柱。