长期股权投资、固定资产与无形资产虽同属于非流动资产，但它们各自业务的内容及其特点决定了它们在内部控制实践上的差异，也导致了它们在会计制度设计上的不同。企业长期股权投资通常涉及企业整体经营策略和长期发展规划，意味着企业巨额现金流出，同时还面临着持有期间对被投资单位的管理、投资收益计算以及减值测试等复杂问题。因此，企业必须加强长期股权投资业务内部控制，规范长期股权投资行为，防范长期股权投资风险，保证长期股权投资安全与提高长期股权投资效益。
其内部控制设计的总体要求包括：（1）职责分工、权限范围和审批程序应当明确，机构设置和人员配备应当科学合理（2）投资项目建议书和可行性研究报告的内容应当真实，支持投资建议和可行性的依据与理由应当充分、可靠（3）投资方案应当科学完整；投资合同或协议的签订应当征求法律顾问的意见；对投资项目的跟踪管理应当全面及时；投资收益的确认应当符合规定；投资权益证书的管理应当严格有效；计提对外投资减值准备的依据应当充分，审批程序应当明确（4）投资处置的方式应当明确，与投资处置有关的文件资料和凭证记录应当真实完整。固定资产是指使用期限较长，单位价值较高，并且在使用过程中能够保持原有实物形态的资产。固定资产的安全、完整直接影响到企业生产经营的可持续发展能力。因此，企业应加强对固定资产的内部控制，防止并及时纠正固定资产业务中的各种差错和舞弊行为，保护固定资产的安全完整，提高固定资产的使用效率。
其内部控制总体措施是：（1）权责分配和职责分工应当明确，机构设置和人员配备应当科学合理（2）固定资产取得依据应当充分适当，决策和审批程序应当明确（3）固定资产业务各环节的控制流程应当清晰，固定资产投资核算、工程进度、验收使用、维护保养、内部调剂、淘汰处置等应当有明确的规定（4）固定资产成本核算、计提折旧和减值准备、处置等会计处理应当符合国家统一的会计制度规定。
无形资产是指企业拥有或者控制的没有实物形态的可辨认的非货币性资产，主要包括专利权、非专利技术、商标权、著作权、特许权、土地使用权等。与有形资产相比，它具有三个基本特征：一是不具有实物形态；二是能够在多个会计期间为企业带来经济利益；三是能够提供的未来经济效益具有高度的不确定性。无形资产业务基本流程包括取得无形资产；组织验收，确定权属关系；使用与保全；技术升级、更新换代；无形资产处置等环节。
企业应该明确无形资产业务流程中的主要风险，设计适当的无形资产业务内部控制，其要点包括以下几项：（1）取得无形资产与组织验收，确定权属关系（2）使用与保全（3）技术升级、更新换代（4）无形资产处置。