格式合同须严格遵守法律的强行性规定，否则导致无效。而非格式合同的内容则完全由当事人双方协商确定，并可根据情况约定变更。正因为如此，法律通常要对格式合同的权利义务做出规定，目的在于尽可能在公平的前提下，保证处在弱势的相对人利益受到切实保障，新颁布的《合同法》在“合同的订立”一章中就有关于格式合同的专门规定。
（我国合同法第41条规定："对格式条款的理解发生争议的，……应当作出不利于提供格式条款的一方当事人的解释。格式条款与非格式条款不一致的，应当采用非格式条款。"这一规定体现了格式条款中的保护弱者利益原则。
（1）由于格式合同的条款是由商品或服务的提供者拟订的，而相对人一方又是弱者。所以，在对合同条款发生歧义需要解释时，当某一条款有几种解释方法，其中某种解释有利商品或服务的提供者，而另一种解释则对相对人有利的话，即应解释得有利于相对人而不利于条款的拟定者。
（2）当某一合同既存在格式合同条款，又存在非格式合同条款，例如补充协议时，如果两种条款发生冲突，出现不一致的情况时，即应当采用非格式合同条款。）