首先要根据畜禽的种类、生长阶段、生产方向、抗生素使用目的等选择合适的抗生素种类，并确定抗生素的使用剂量，作为添加剂使用的抗生素应尽量避免使用人、畜临床治疗用抗生素，同时不能长期使用一种抗生素；为避免产生抗药性及药物残留问题，生产中可采用交替使用抗生素或间隔使用抗生素的方法，并严格控制抗生素的添加量，禁止仅考虑经济利益的而无原则的滥用抗生素；
另外，为了使畜产品中抗生素的残留量降低到最低限度，畜禽在屠宰前必须严格执行停药期；当抗生素作为添加剂使用需要联合用药时，必须严格遵守我国农业部颁发的饲料添加剂配伍禁忌的规定。