防治应以预防为主，采取综合措施进行防治：如
①在种植前，检查百合鳞茎的鳞茎盘部分是否已被真菌浸染；
②消毒栽培土壤并严格防止连作；
③（虽然商品种球一般已经消毒处理）种植前对种球进行再消毒，如用多菌灵500倍液浸种等；
④设施内避免土壤及空气过分潮湿；
⑤生长旺期后，尽量不向叶面浇水，当叶片存有露水或保护地内湿度过大时，避免气温突然升高；
⑥发病时，及时喷施百菌清、代森锰锌等杀菌剂，发现病株应及时拔除销毁。