设施番茄栽培多采用单蔓整枝，即每枝只保留主枝，所有侧枝全部去除。无限生长型品种留5层果左右，摘心。
采用吊蔓栽培系统，即植株上方距畦面2.5m（日光温室低些）处沿畦方向按行分别拉一道10号铁丝，每个植株上方用吊绳活动挂钩挂在铁丝上，挂钩可在铁丝上移动。
采用单干整枝，当侧枝长至6cm长时及时取掉。随着植株生长，把茎干缠绕在吊绳上。