1.病因：
（1）细菌（弧菌、丝状细菌）、真菌（镰刀菌病）感染，固着类纤毛虫附生；
（2）水质底质恶化，pH值长期偏低，水体氨氮和亚硝酸盐含量过高；
（3）防治虾病时使用的药物不恰当，如硫酸铜、高锰酸钾（铜离子可直接损伤鳃丝，高锰酸钾的锰形成二氧化锰黏附在鳃丝表面，都可引起黑鳃）
（4）长期缺乏维生素C（白黑斑病、黑斑病、黑鳃病）。
2.诊断：剪取部分鳃丝做水浸片镜检：
（1）鳃丝表面有污物附生，鳃组织并不变黑——丝状细菌、固着类纤毛虫、海藻引起的黑鳃；
（2）鳃丝组织坏死变黑——弧菌、镰刀菌等；非生物病因。
3.防治：
（1）细菌性黑鳃可口服氟哌酸、土霉素等抗生素进行防治；
（2）镰刀菌、固着类纤毛虫引起的黑鳃：福尔马林、含氯消毒剂消毒水体；
（3）对于因水质恶化引起的黑鳃，可采用换水、添加光合细菌等生物制剂、以及泼洒沸石粉或白云石粉等措施防治；
（4）因维生素C缺乏引起的黑鳃可在饵料中添加维生素C。