树洞处理的方法为了防止树洞继续扩大和发展，常采用以下3种方法进行修补。
1、开放法：树洞不深或树洞过大都可以采用此法，如伤孔不深无填充的必要时可按前面介绍的伤口治疗方法处理。如果树洞很大，给人以奇特之感，欲留做观赏时可采用此法。方法是将洞内腐烂木质部彻底清除，刮去洞口边缘的死组织，直至露出新的组织为止，用药剂消毒并涂防护剂。同时改变洞形，以利排水，也可以在树洞最下端插入排水管。以后需经常检查防水层和排水情况，防护剂每隔半年左右重涂一次。
2、封闭法：树洞经处理消毒后，在洞口表面钉上板条，以油灰和麻刀灰封闭（油灰是用生石灰和熟桐油以1：0.35）（也可以直接用安装玻璃用的油灰俗称腻子），再涂以白灰乳胶，颜料粉面，以增加美观，还可以在上面压树皮状纹或钉上一层真树皮。
3、填充法：填充物最好是水泥和小石砾的混合物，如无水泥，也可就地取材。填充材料必须压实，为加强填料与木质部连接，洞内可钉若干电镀铁钉，并在洞口内两侧挖一道深约4em的凹槽，填充物从底部开始，每20~25cm为一层用油毡隔开，每层表面都向外略斜，以利排水，填充物边缘应不超出木质部，使形成层能在它上面形成愈伤组织。外层用石灰，乳胶，颜色粉涂抹，为了增加美观，富有真实感在最外面钉一层真的树皮。
主要步骤是清理、凿铣；整形；消毒和涂漆。
（一）清理：
（二）整形：
1、内部整形：目的是消灭水袋，防止积水。又分为浅树洞的整形和深树洞的整形。
2、洞口的整形与处理：
（三）树洞加固；螺栓加固和螺丝加固。
（四）消毒和涂漆：对树洞内表的所有木质部涂抹木馏油或3%的硫酸铜溶液。消毒后再对所有外露木质部涂漆。