常见的方剂分类法主要有七方分类说、病证分类法、祖方（主方）分类法、功用（治法）分类法、综合分类法。
“七方”说（大、小、缓、急、奇、偶、复）始于《黄帝内经》。
按病证分类有：《五十二病方》、《伤寒杂病论》、《外台秘要》、《太平圣惠方》，《普济方》、《张氏医通》、《兰台轨范》，并包括脏腑分类的《备急千金要方》、以及病因分类的《三因极一病证方论》等。
组方（主方）分类法有《祖剂》、《张氏医通·祖方》。
按功用（治法）分类法有《圣济经》的宣、通、补、泻、轻、重、涩、滑、燥、湿剂（《伤寒明理论》明确提出“十剂”说），《景岳全书》补、和、攻、散、寒、热、固、因的“八阵”分类法，及《医学心悟》的八法分类。
综合分类法为《医方集解》所开创，分别为补养、发表等22剂，《成方切用》、《成方便读》及现代方剂学教材都借用或参考了综合分类法。