魏晋南北朝是我国历史上一大分裂时期，这一时期中枢秘书机构演进的过程，其基本线索就是：以中书省取代尚书台，设门下省分散中书省之权，初步形成了中书、门下、尚书三个相互配合，又相互制约的秘书机构。
（1）设中书省替代尚书台。中书省起初的职责是“掌赞诏命，记会时事，典作文书”，即负责起草诏命、记录朝廷大事，拟制文书，是皇帝的机要秘书处。后来，随着业务日繁，中书省要负责21方面的事务，直接与行政中枢尚书省的各曹对口，渐渐发展为规模很大的朝廷的“办公厅”。
（2）设门下省分中书省之权。门下省在皇帝左右议论大政，出宣诏命，办理交付事项等。这样，门下省就分掌了中书省的一部分秘书工作，分散、限制了中书省的权力。