（1）缺乏持续改善政府部门绩效的外在压力。相对于私营部门面临激烈的市场竞争，稍有不慎就可能在竞争中出局的境况，政府部门缺乏感受外在压力的敏感性。
（2）缺乏衡量政府服务绩效的客观标准。
（3）政府部门目标的多样性。
（4）政府部门的保守天性也制约着标杆管理方法在政府部门的应用前景。
（5）政府部门的财政约束。

（1）纵向集权与横向分权的矛盾。
（2）部门政策与地方政策的矛盾。
（3）地方收入与支出的矛盾。