最主要的问题是没有摆脱冯·诺依曼体系结构的影响，捕获的功能过程和数据恰恰是客观事物的易变性质，由此建造的系统结构很难与客观实际系统的结构保持一致。在某种意义上说就是这些问题促使面向对象方法学的产生和发展。

区别：变换设计的目标是将变换型数据流图映射为模块结构图，而事务设计的目标是将事务型数据流图映射为模块结构图。