单细胞生物，个体差异大，几微米到几十微米不等，无细胞壁，外有一层质地富弹性的膜；一个或多个细胞核，为真核，形成食物泡，有伸缩泡，无液泡；食物方式为：吞食小动物、细菌等固体物质，食物溶于体内消化；鞭毛、纤毛或伪足运动。
生殖方式：
1、无性生殖：二分分裂，孢子有丝分裂（核分裂核膜不消失），鞭毛型为纵分，其他为横分裂。
2、有性生殖：孢子结合，纤毛虫纲为接合，同形、异形孢子。形成休眠体，能抵抗外界不良环境。
用途
在废水处理中主要是细菌的作用，分解有机质的能力最强；其次为原生动物，占总微型动物的90％以上。
1、原生动物对废水净化的影响；
1.原生动物因能直接利用有机质而起废水净化作用；
2.纤毛虫类可促进生物絮凝作用，促进净化；
3.原生动物靠吞食细菌改善出水质量。
2、以原生动物为生物指标
依据：各种原生动物的环境要求不同，利用种群的生长情况。
控制内容：
1.原生动物种类的变化及组成。
2.各种种类的数量变化当曝气池中有机负荷、曝气时间、有机质去除率大幅度变化时，种类变化小，而各主要种类的数量变化大。
3.各种群的代谢活动的变化。