基质脱氢主要有四种途径。
1.EMP途径又称糖酵解途径，是绝大多数生物所共有的一条代谢途径。它以1分子葡萄糖为基质，约经过10步反应而产生2分子丙酮酸、2分子NADH⁺H⁺和2分子ATP的过程。
2.HMP途径又称戊糖磷酸途径，己糖--磷酸途径等。其特点是葡萄糖不经过EMP途径和TCA循环而得到彻底氧化，并能产生大量NADPH⁺H⁺形式的还原力及多种中间代谢产物。
3.ED途径这是存在于某些缺乏完整EMP途径的微生物中的一种替代途径。特点是葡萄糖只经过4步反应即可快速获得经由EMP途径需10步反应才能形成的丙酮酸。
4.TCA循环指由丙酮酸经过一系列循环式反应而彻底氧化、脱羧，形成CO₂、H₂O和NADH₂的过程。