一般是将安全管理体系第一个层次的文件——安全和环保方针编入安全管理手册，并由该手册对整个安全管理体系作系统的描述。在安全管理手册之下，一般是将安全管理体系的第二层次的文件——程序，汇入程序文件册。在程序文件之下，一般是将安全管理体系的第三个层次的文件——须知，如安全管理职责、船舶操作、船舶维护、船舶应急等操作文件编入须知文件册，须知文件可以分成安全管理职责文件、船舶操作文件、船舶维护文件、船舶应急计划等几本，其具体的体系文件结构如下：