两栖类的卵是均黄卵，辐射型卵裂，两栖类的第一、二次卵裂是完全均等分裂（经裂），第三次是纬裂。
两栖类的囊胚腔的形成可追溯到第一次卵裂，是偏腔囊胚。在非洲爪蟾，第一次卵裂的近动物极卵裂沟较宽，形成一个小的细胞间的腔，在以后的分裂过程中，该腔不断扩大而成为囊胚腔。
原肠胚形成，首先在囊胚的赤道下方内陷，出现一条浅横沟，这边上新月型原口，沟的上方为背唇，浅沟里的小腔就是原肠腔的开始。内陷继续深入，原肠腔也扩大。犹豫背唇出现，细胞内陷，因此动物极的细胞就向下包，逐渐覆盖卵黄细胞。与此同时，细胞也从背唇开始卷入，植物极的细胞也被动的内陷。原肠腔不断扩大，许多细胞不断向背唇集中、卷入，新月形原口向两侧扩展成马蹄形原口，最后成为一个环形的原口，胚孔内为乳白色的植物极细胞，是卵黄栓。在胚胎内部，卷入的细胞向前延伸以后将分化为脊索、中胚层，内陷的细胞将分化为内胚层。在动物极外面的细胞尚有两层，最外面的将分化为表皮等，里面的一层将分化为神经系统。所以，蛙的原肠形成的细胞运动既有内陷我、外包、内卷，也有集中、伸展等。
两栖类中大部分属初级神经胚形成，只有尾神经管通过次级神经胚形成产生。初级神经胚的形成过程：外胚层预定形成神经组织，背中线处外胚层细胞的变长使预定神经区上升到周围外胚层的上面，由此形成神经板。神经板形成后不久边缘加厚并向上翘起形成神经褶，在神经板中央出现的U型沟即神经沟，他将胚胎未来的右边和左边分开。神经褶向胚胎背中线迁移，最终合拢形成神经管，上面覆盖着外胚层。神经管最靠背面部分（两神经褶连接处）的细胞变成神经嵴细胞。