该模块包含科目代码选择、会计核算主体所属征收单位设置、会计科目设置、原始凭证设置、年终结转冲销定义、分户欠税转入、期初余额设置和规则检验等。其中科目代码选择、会计科目设置、原始凭证设置、年终结转冲销定义、分户欠税转入、期初余额设置和规则检验等一般在CTAIS系统启动时设置完成，以后不再调整。
会计核算主体所属征收单位设置需要各核算单位税收会计岗人员根据某单位的机构变化及时进行设置处理。在CTAIS中按：征收监控—税收会计—数据维护—会计主体核算单位设置的顺序进入本模块，增加或删除核算主体下面的所属税务机关并保存（机构增减变动时尤其要注意，否则入库数据与金库对帐不符）。

重点税源报表数据处理有两种方式，一种通过手工录入，另外一种通过自动采集。

应注意不要选择由本地更新数据库表样，在删除报表时应选择从报表夹中删除。

因为核定征收企业不享受税务减免优惠。所以，企业所得税核定征收申报表就没有经批准减免税额栏。

升级后的企业所得税季度申报表简化为十栏。