（1）直接从染色体DNA中分离：
仅适用于原核生物、叶绿体和线粒体基因的分离，较少采用。
（2）人工合成：
根据已知多肽链的氨基酸顺序，利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。
（3）从mRNA合成cDNA：
采用一定的方法钓取特定基因的mRNA，再通过逆转录酶催化合成其互补DNA（cDNA），除去RNA链后，再用DNA聚合酶合成其互补DNA链，从而得到双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。
（4）利用PCR合成：
如已知目的基因两端的序列，则可采用聚合酶链反应（polymerase  chainreaction，PCR）技术，在体外合成目的基因。
（5）从基因文库中筛选：
首先建立基因组或cDNA文库，利用探针从文库中筛选目的克隆。

（1）酶切法
（2）PCR法
（3）化学合成法
（4）基因组或cDNA文库法

1）核酸杂交法
①菌落印迹原位杂交；
②斑点印迹杂交；
③Southern印迹杂交
2）聚合酶链式反应法
3）DNA测序法

①悬浮培养：
②贴壁培养；
③固定化培养；
④大规模培养（包括空心纤维法，微载体法，微胶囊法）。