II组内含子和前mRNA的剪接有着相同的反应机制、相同的剪接位点，在催化中心形成相同的二级结构。前mRNA内含子可能由II组内含子进化而来。在进化过程中，II组内含子中被切除的结构域插入到分隔的基因中，这些结构域呆能成为snRNA。它们通过分开片段的相互作用形成II组内含子的催化中心。这对生物体来说是有利的，因为它们不再需要内含子了。内含子序列可以自由地进化形成新基因，而且它提供了多种II组内含子不具备的剪接方式。

U1-5′剪接位点、U2-分支位点、U4-46、U2-U6、U6-5′剪接位点、U5-外显子。

5.8SrRNA是作为前体rRNA大分子的一部分被转录的。