（1）食物中毒类型调查。首先要确定疾病的发生是否是食物中毒，如果是食物中毒，就要确定属于何种类型的食物中毒，为此要进行三方面的工作，即流行病学调查、临床诊断和实验室诊断。
（2）有毒食品调查。在食物中毒调查中调查并确定有毒食品时进行食物中毒的诊断和处理即为重要的环节，初步确定可疑有毒食品后，应迅速采集样品送检，以检验出有毒物质或微生物污染食品的情况。
（3）中毒原因调查。中毒原因调查是指对可疑有毒食品的来源、被污染的环节、运转的途径以及造成中毒的条件等情况的调查。一般是以发生中毒的单位为起点，按照食品的来源途径进行追溯调查。
（4）中毒患者个案调查。中毒患者个案调查是对中毒者的一般情况、进食有毒食品情况、发病情况和症状表现、实验室检验结果和病程愈后等情况进行调查，一般采用调查表形式，并进行所有中毒者调查结果的汇总分析。