利用分子标记进行MAS育种必须具备如下条件：
①分子标记与目标基因共分离或紧密连锁，一般要求两者间的遗传距离小于5cm，最好1cm或更小。
②具有在大群体中利用分子标记进行筛选的有效手段，目前，主要应用自动化程度高，相对易于分析，且成本较小的PCR技术。
③筛选技术在不同实验室间重复性好，且具有经济、易操作的特点。
④应有实用化程度高并能协助育种家作出抉择的计算机数据处理软件。