植物线粒体内膜上的电子传递链由4种蛋白复合体组成。
复合体Ⅰ（complex  I），也称NADH脱氢酶（NADH  dehydrogenase)，由结合紧密的辅因子FMN和几个Fe-S中心组成，其作用是将线粒体基质中的NADH+H⁺的2对电子即4个质子泵到膜间间隙（intermembrane  space)，同时复合体也经过Fe-S中心将电子转移给泛醌（ubiquinone，UQ或Q）。
复合体Ⅱ（complex  Ⅱ），又叫琥珀酸脱氢酶（succinate  dehydrogenase)，由FAD和3个Fe-S中心组成。它的功能是催化琥珀酸氧化为延胡索酸，并把H转移到UQ生成UQH₂。此复合体不泵出质子。
复合体Ⅲ（complex  Ⅲ），又称细胞色素bc1复合物（Cytochrome  bc₁  complex），它氧化还原型泛醌，生成UQH₂，UQH₂把电子经过1个Fe-S中心，2个Cytb（Cytb₅₆₅和Cytb₅₆₀）和1个Cytc₁最后传到Cytc。Cytc是小蛋白体，疏松地附在内膜的外表面，其功能是在复合体Ⅲ和Ⅳ之间传递电子。此复合体泵出4个质子到膜间间隙。
复合体Ⅳ，又称细胞色素氧化酶（Cytochrome  oxidase)，含2个铜中心（CuA和CuB.，Cyta和Cyta₃。复合体Ⅳ是末端氧化酶（terminal  oxidase).，把Cytc的电子传给O₂，激发O₂并与基质中的H+结合形成H₂O，每传递一对电子时，有2个H⁺泵出。